項目: PWSC(2016-17)4363TR沙田至中環線－鐵路建造工程－前期工程
應急費用的運用
陳振英議員引述討論文件附件5，認為有關應急費用的載列方式有誤導之嫌，未能反映部分應急費用已撥作支付因各項原因引致的額外開支。
路政署署長表示，按照工務工程項目的一般做法，工程預算費一般包括預留的應急費用，當局或會就某些工程計劃採用較高或較低的應急費百分比。若把應急費用的分項開支詳細列出，反而不能令委員掌握應急開支運用的全貌。鑒於有關前期工程已大致完成，港鐵公司已計算出一個比較準確的額外開支金額，政府當局亦已詳細審核，估計尚餘的應急費用足以應付日後的應急開支。
調整向港鐵公司支付的費用
陳振英議員引述討論文件第23段，指出政府當局向港鐵公司支付的項目管理費用的減幅約為2億1,200萬元。他詢問，當局是否因港鐵公司監督工程不力，而下調向其支付的項目管理費用，以及有關減幅如何釐定。
路政署署長答稱，政府當局在2011年為沙中線前期工程申請撥款時，已在63TR號工程計劃之下暫定預留7億1,050萬元的項目管理費用，用以支付港鐵公司在有關前期工程施工階段進行的技術研究、設計、監管施工及管理合約的工作。該金額為暫定金額，是按一貫的基準，即工程預算費用的16.5%計算。其後，路政署聘請的獨立顧問就整項沙中線的建造預算進行審視後，當局與港鐵公司進一步磋商，把在63TR號工程計劃下所支付的項目管理費用預算下調至4億9,850萬元，有關的百份比因而下調。下調項目管理費用並非用作抵銷工程項目部分超支費用。